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DAY 13
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生資的路且重且遠,我要被鴨垮了Q系列 第 13

Day13. GIAB -- gene ID

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Genome in a Bottle (GIAB) Consortium是一個由NIST(National Institute of Standards and Technology)主辦的公共-私營-學術聯合體,旨在開發技術的基礎(參考標準、參考方法和參考數據),以促使整個人類基因組序列分析應用於臨床實踐和技術創新。GIAB的主要目標是權威性地表徵人類基因組,以用於基準化、分析驗證和技術開發、優化和演示。

以下是這些ID的解釋:

  1. Coriell ID:Coriell Institute是一家生物醫學研究機構,他們可能會為樣本分配一個獨特的Coriell ID,以便在其內部管理和記錄樣本的相關信息。

  2. NIST ID:NIST(National Institute of Standards and Technology)是主辦GIAB的機構,他們可能會為樣本分配一個獨特的NIST ID,以在其內部管理和記錄相關信息,包括樣本的比對結果等。

  3. iPSC ID(Parental Cell Type):iPSC代表人類誘導多能干細胞(induced pluripotent stem cell),它們是一種特殊的細胞類型。這個ID可能用於樣本的細胞來源跟蹤,以確保知道樣本是從哪種細胞類型中獲得的。

總之,這些不同的ID用於確保sample的唯一性、追蹤性以及管理。不同的機構或計劃可能使用自己的識別方式,但最終它們都指的是同一個樣本,並且用於不同層面的管理和記錄。

https://ithelp.ithome.com.tw/upload/images/20230924/201334001e8Q2VOaLV.png

這裡就可以知道,例如 Coriell ID NA12878 就是 NIST ID 的 HG001 ,是同一個sample ,所以當你在某篇論文看到用 NA12878 ,別的論文用 HG001,那其實他們用的是同一個 sample。
至於更多的不同 ID 體系的 sample 比較,可以到時候查查,有時候會發生很好笑的事情,原來你以為跟同學講的sample 不同,結果是一樣的(我還真的遇過....)。

Source

Guidelines for Human Gene Nomenclature
NIST


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